Структура
Управление Учреждением осуществляется в соответствии с законодательством Российской Федерации с учетом особенностей, установленных Федеральным законом от 29 декабря 2012 года № 273-ФЗ "Об образовании в Российской Федерации".
Управление образовательной организацией осуществляется на основе сочетания принципов единоначалия и коллегиальности. Единоличным исполнительным органом является директор, назначенный на должность главой администрации города Чебоксары.
Органами коллегиального управления Учреждения являются:
Общее собрание работников;
Педагогический совет;
Управляющий совет.
Структурных подразделений нет.
Положение об общем собрании работников 
Компетенции коллегиальных органов управления описаны в Уставе.
Школа имеет в своей структуре 1 корпус.
Корпус (ул. Урукова, 11А): медицинский кабинет, процедурный кабинет, стоматологический кабинет, школьная столовая, спортивный стадион, гимнастический зал, тренажерный зал, библиотеку, актовый зал, совмещенный со столовой; учебные кабинеты.
МБОУ "СОШ 31" г.Чебоксары не имеет в своей структуре филиалов, представительств и иных структурных подразделений.
Управляющий совет
Функции и полномочия управляющего совета МБОУ "СОШ №31" города Чебоксары прописаны в Уставе учреждения.
Положение об Управляющем совете
Педагогический совет
Функции и полномочия педагогического совета МБОУ "СОШ №31" города Чебоксары прописаны в Уставе учреждения.
Положение о педагогическом совете
Совет родителей
Совет обучающихся
